FAIR WISH: FAIR Workflows to establish IGSN for Samples in the Helmholtz Association
„FAIR Workflows zur Etablierung von IGSN für Proben in der Helmholtz-Gemeinschaft“ (FAIR WISH) ist ein gemeinsames Projekt der Helmholtz-Zentren GFZ, AWI und Hereon, das im Rahmen der HMC Projektkohorte 2020 der Helmholtz Metadata Collaboration (HMC) Plattform gefördert wird.
Die Internationale Generische Proben-Nummer (IGSN) ist ein weltweit eindeutiger und persistenter Identifikator (PID) für physische Proben und Sammlungen mit einer Entdeckungsfunktion im Internet. IGSNs ermöglichen es, Daten und Publikationen direkt mit den Proben zu verknüpfen, aus denen sie stammen, und schließen so eine der letzten Lücken in der vollständigen Provenienz von Forschungsergebnissen.
FAIR WISH wird (1) standardisierte und disziplinspezifische IGSN-Metadatenschemata für verschiedene Probentypen im Forschungsfeld Erde und Umwelt (EaE) entwickeln, die das Kern-IGSN-Metadatenschema ergänzen; und (2) Workflows entwickeln, um maschinenlesbare IGSN-Metadaten aus verschiedenen Digitalisierungszuständen (von Vorlagen bis Datenbanken) zu generieren und IGSNs automatisch zu registrieren. Unsere Anwendungsfälle wurden so ausgewählt, dass sie die große Vielfalt an Probentypen aus verschiedenen Subdisziplinen der Projektpartner abdecken (z.B. terrestrische und marine Umwelten, Gestein, Boden, Vegetation, Wasserproben) und alle Digitalisierungsstufen repräsentieren: von einzelnen Wissenschaftlern, die Probenbeschreibungen in ihren Feldbüchern sammeln, bis hin zu digitalen Probenmanagementsystemen, die von einer App gespeist werden, die im Feld genutzt wird.
https://zenodo.org/communities/fair_wish/?page=1&size=20
https://zenodo.org/record/6787200#.ZBL73R8xmUk
https://helmholtz-metadaten.de/storage/1117/04_FAIR-WISH_HMC.pdf
Publikationen:
M Wieczorek et al.: “On FAIR Data and samples”, International Paleofire Network workshop: Long‐term fire‐vegetation change: data‐based challenges. 13.‐17.02.2023; https://events.gwdg.de/event/377/contributions/788/.
B. Heim et. al.; “Central and Eastern Siberian High Latitude Lake Hydrochemistry”, EGU 2023, Vienna, 23.‐27.04.2023; https://doi.org/10.5194/egusphere‐egu23‐16527.
L. Baldewein et al.; “HCDC datasearch portal: Replacing legacy solutions with a unified open‐source portal”, EGU 2023, Vienna, 23.‐27.04.2023; https://doi.org/10.5194/egusphere‐egu23‐3269.
M. Wieczorek et al.; “FAIR WISH project – developing metadata templates for IGSN Registration for various sample types”, EGU 2023, Vienna, 23.‐27.04.2023; https://doi.org/10.5194/egusphere‐egu23‐13514.
M. Wieczorek et al.; “The FAIR SAMPLES template for IGSN sample registration”, Data Science Symposium No. 9, 2023, 04.05.2023.
Brauser et al.; “Improving Sample Metadata Descriptions in EaE Sciences by using the FAIR SAMPLES Template”, Berlin 2023, 06.09.2023.
Brauser et al.; “Introduction to the IGSN data model”, regular internal meeting on "Utilisation and integration of a sample management tool in pilot laboratories of the GFZ", 20.10.2023.
K. Elger et al.; “Making your samples FAIR – tools and recommendations from the FAIR WISH Project”, HMC Conference, Online, 10.‐12.10.2023; https://doi.org/10.5281/zenodo.10698918.
K. Elger; “Using PIDs in a domain repository – benefits and challenges”, International Data Week, Salzburg, 23.‐26.10.2023.
Baldewein, Linda, Brauser, Alexander, Elger, Kirsten, Heim, Birgit, & Wieczorek, Mareike. (2022). FAIR WISH D1 - List of identified linked open data vocabularies to be included in IGSN metadata (Version 1). Zenodo. https://doi.org/10.5281/zenodo.6787200.
Brauser, A., Wieczorek, M., Frenzel, S., Heim, B., Baldewein, L., Kleeberg, U., & Elger, K. (2023). FAIR WISH: Sample description template. Zenodo. https://doi.org/10.5281/ZENODO.7520015.
Elger, K., Frenzel, S., & Brauser, A. (2022). IGSN International Generic Sample Numbers - uniquely identifying your samples. https://doi.org/10.5281/ZENODO.7370845.
Wieczorek, Mareike, Heim, Birgit, Brauser, Alexander, Elger, Kirsten, & Baldewein, Linda. (2022a). FAIR WISH D2 - Exemplary standardised metadata templates for Geo-Bio samples (vegetation, wa-ter, sediment, rock samples) for all use cases. Zenodo. https://doi.org/10.5281/zenodo.7147532.
Wieczorek, Mareike, Heim, Birgit, Brauser, Alexander, Elger, Kirsten, & Baldewein, Linda. (2022b). FAIR WISH D3 - Assisting and Assessing User application of the FAIR SAMPLES Template. Zenodo. https://doi.org/10.5281/zenodo.7377904.
Wieczorek, Mareike, Brauser, Alexander, Heim, Birgit, Baldewein, Linda, & Elger, Kirsten. (2022c). Video Tutorial for the FAIR SAMPLES Template. Zenodo. https://doi.org/10.5281/zenodo.7381390.
Edmunds, K. & Elger., K.; Poster „IN25D-0353: The IGSN–DataCite Partnership: Realizing the IGSN 2040 Vision”, AGU 2022 (Dec 12-17, 2022; Chicago)
Elger K. et al., Talk “Project FAIR WISH: FAIR Workflows to establish IGSN for Samples in the Helmholtz Association”, HMC conference (Oct 5-6, 2022; online)
Wieczorek M. et al., Poster „FAIR WISH project – Developing templates to register IGSNs for various sample types”, HMC conference (Oct 5-6, 2022; online)
Baldewein, L. et al., Conference Presentation “FAIR WISH - FAIR Workflows to establish IGSN for Samples in the Helmholtz Association”, Data Science Symposium No. 7 (2022)
Baldewein, L. et al., vPICO/Conference Presentation “FAIR WISH - FAIR Workflows to establish IGSN for Samples in the Helmholtz Association”, EGU 2022 (May 23-27, 2022; Vienna)
Frenzel, S. et al., Documentation of the GFZ ISGN metadata schema (version 1) (internal, not yet publicly available)
Heim, B. & Wieczorek, M.; Lecture „Data Collection course in Earth sciences (outreach: students learn about best practice in sample collection, IGSN)“, University Potsdam