O2A SAMPLES – From Expedition to Digital Database – A Unified Framework for Sample Digitization and Interoperability

O2A SAMS, jetzt O2A SAMPLES, befasst sich mit der bestehenden Fragmentierung im Probenmanagement der Umwelt- und Erdsystemforschung. Derzeit werden biologische, geologische, glaziologische und aquatische Proben oft in isolierten Systemen verwaltet, was die Interoperabilität einschränkt, den wissenschaftlichen Fortschritt verlangsamt und die Einhaltung internationaler Standards erschwert. O2A SAMPLES baut auf einem bestehenden open-source Prototypen auf und entwickelt ihn zu einer einheitlichen, gehosteten Plattform weiter, die verschiedene Probenmetadaten in einem interoperablen Rahmen zusammenführt. Der Dienst wird Helmholtz-Zentren, Universitäten und externen Partnern zur Verfügung stehen und eine konsistente, transparente Probenhandhabung entsprechend der FAIR-Prinzipien ermöglichen.

Das Projekt zielt darauf ab, ein produktionsreifes System zu liefern, das den gesamten Lebenszyklus des Probenmanagements unterstützt, von der Probennahme im Feld bis zur Langzeitarchivierung. O2A SAMPLES ist mit etablierten Infrastrukturen wie dem O2A REGISTRY, OSIS, PANGAEA und dem Earth Data Portal verbunden. Diese Zusammenhänge gewährleisten einen zuverlässigen Datenaustausch, Rückverfolgbarkeit und die Einhaltung des Nagoya-Protokolls. Die Plattform unterstützt persistente Identifikatoren über DataCite als IGSNs, QR-basierte Nachverfolgung, automatische Metadatenerfassung und standardisierte Workflows, die den manuellen Aufwand reduzieren und die Reproduzierbarkeit verbessern.

Ein zentraler Bestandteil des Projekts ist die Entwicklung fachspezifischer Standardarbeitsanweisungen und harmonisierter Arbeitsabläufe. Die Metadaten werden an FAIR WISH und internationalen Metadatenstandards ausgerichtet, um eine konsistente Dokumentation für alle Probentypen zu gewährleisten. Dies ermöglicht Forschern eine effektivere Suche, Ausleihe, Wiederverwendung und Integration von Proben. Ein Toolkit für den Feldeinsatz unterstützt die zuverlässige Probenregistrierung in schwierigen Umgebungen durch eine mobile Anwendung mit Offline-Funktionen, QR-Code-Scanning und automatisiertem Daten-Upload.

Der Aufbau einer Community und die langfristige Nachhaltigkeit sind integraler Bestandteil des Projekts. Schulungsmaterialien, Workshops und ein zugehöriges Support-Portal werden eine wachsende Praxisgemeinschaft innerhalb der Helmholtz DataHub AG Sample Management fördern. Kontinuierliches Feedback und gemeinsame Weiterentwicklung werden sicherstellen, dass das System relevant und anpassungsfähig bleibt. Als offene, modulare Plattform ist O2A SAMPLES auf Skalierbarkeit und zukünftige Integration neuer Technologien ausgelegt.

O2A SAMPLES wird die FAIRness, die Zugänglichkeit und den wissenschaftlichen Wert physischer Proben innerhalb der Helmholtz-Gemeinschaft und darüber hinaus erheblich verbessern.